В настоящее время Департамент является одним из крупнейших в системе Росгидромета, является его территориальным органом в ДФО. В зону его деятельности входят территории трех субъектов Российской Федерации: Хабаровский край, Еврейская Автономная и Амурская области. По ряду полномочий, таких как контроль деятельности лицензиатов, государственный контроль над проведением работ по активному воздействию на метеорологические и другие геофизические явления, полномочия определенные Кодексом Российской Федерации об административных правонарушениях зона деятельности, согласование проектов нормативов НДС – территория Дальневосточного федерального округа. Департамент выполняет функции специально уполномоченного государственного органа по организации единой системы наблюдений и обеспечения органов власти, предприятий и организаций различных отраслей экономики и населения информацией о сложившихся и ожидаемых гидрометеорологических условиях, а также данными о загрязнении окружающей природной среды на закрепленной территории. Департамент Росгидромета по ДФО имеет два крупных подведомственных Центра – в Хабаровске и Благовещенске.